Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms