Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Cngb1E1AZ71 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cngb1E1AZ71 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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