Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc6D3YZP9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc6D3YZP9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms