Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms