Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm17333C6EQI3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm17333C6EQI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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