Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cttnbp2B9EJA2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms