Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah3B2RWG3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms