Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apba1B2RUJ5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms