Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms