Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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H60cB1B213 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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H60cB1B213 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H60cB1B213 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H60cB1B213 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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H60cB1B213 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H60cB1B213 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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H60cB1B213 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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H60cB1B213 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H60cB1B213 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H60cB1B213 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H60cB1B213 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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H60cB1B213 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms