Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms