Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap221A9Q751 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms