Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm11127A7VMS2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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