Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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