Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Fam43bA2AM80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Fam43bA2AM80 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Fam43bA2AM80 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam43bA2AM80 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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