Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
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