Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28490A0A087WRT9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28490A0A087WRT9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm28490A0A087WRT9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28490A0A087WRT9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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