Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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