Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms