Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms