Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VarsQ9Z1Q9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms