Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms