Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X0

Cdc42ep5, Cdc42 effector protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms