Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms