Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms