Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fam50bQ9WTJ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam50bQ9WTJ8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms