Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clec4eQ9R0Q8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clec4eQ9R0Q8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clec4eQ9R0Q8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clec4eQ9R0Q8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clec4eQ9R0Q8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clec4eQ9R0Q8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms