Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms