Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpc1Q9QZF2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms