Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms