Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms