Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms