Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Snai3Q9QY31 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snai3Q9QY31 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Snai3Q9QY31 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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