Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms