Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53inp1Q9QXE4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms