Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms