Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms