Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod4Q9JLH8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms