Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms