Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms