Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms