Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tuba8Q9JJZ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms