Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lmbr1Q9JIT0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms