Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pus3Q9JI38 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms