Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C1ql3Q9ESN4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C1ql3Q9ESN4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms