Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trappc4Q9ES56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc4Q9ES56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc4Q9ES56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc4Q9ES56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc4Q9ES56 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc4Q9ES56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Trappc4Q9ES56 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc4Q9ES56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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