Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms