Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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