Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cab39lQ9DB16 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms