Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn3Q9DAW9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms